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MADRID 26 out. (EUROPA PRESS) -
O Centro Nacional de Pesquisas Cardiovasculares Carlos III (CNIC) e o Centro de Pesquisa Biomédica em Rede de Doenças Cardiovasculares (CIBERCV) desenvolveram o “TurbOmics”, uma ferramenta projetada para integrar diferentes tipos de dados e facilitar a identificação dos mecanismos biológicos envolvidos nas doenças.
Especificamente, trata-se de uma nova plataforma web de acesso aberto que permite integrar e analisar dados de diferentes tecnologias ômicas de maneira simples, intuitiva e acessível para pesquisadores de disciplinas muito diversas.
Segundo explicam no CNIC, para compreender como funcionam as células e os organismos, os cientistas coletam enormes quantidades de informações biológicas provenientes de diversas fontes. Nos últimos anos, os pesquisadores passaram a utilizar sistematicamente ferramentas de análise em massa, denominadas “ômicas”, para obter uma visão holística dos processos biológicos e das doenças. Essa abordagem é conhecida como Biologia de Sistemas.
No entanto, os especialistas apontam que integrar as informações produzidas por diferentes omicas para poder interpretá-las de forma conjunta e coerente continua sendo uma tarefa complexa que, na maioria dos casos, requer conhecimentos avançados de programação e estatística.
Por isso, o CNIC e o CIBERCV desenvolveram o “TurbOmics”, um trabalho publicado recentemente na revista “Genome Biology”. Nesse contexto, a responsável pela plataforma de Metabolômica do CNIC e codiretora do trabalho, Alessia Ferrarini, destacou que um dos principais problemas na metabolômica é que, “ao contrário de outras ômicas, a identificação dos compostos detectados por essa tecnologia não é imediata e requer uma validação posterior trabalhosa”.
Além disso, “quando se pretende combinar esses dados com informações genômicas ou proteômicas, a complexidade aumenta notavelmente”, acrescenta Jesús Vázquez, codiretor do estudo.
“A plataforma incorpora ferramentas para preparar, normalizar e explorar os dados, bem como algoritmos avançados capazes de identificar padrões biológicos comuns entre diferentes camadas de informação”, explicou o pesquisador José Manuel Rodríguez, coautor principal do trabalho. Graças a essas funcionalidades, os usuários podem transformar grandes volumes de dados complexos em resultados de interpretação muito mais imediatos por meio de gráficos e tabelas exportáveis.
O ‘TurbOmics’ foi projetado precisamente para superar essas barreiras e facilitar a análise conjunta de diferentes tipos de dados biológicos a partir de uma única interface gráfica. Segundo Annalaura Mastrangelo, codiretora do estudo, “a plataforma permite que pesquisadores de disciplinas muito diversas possam aplicar metodologias avançadas de integração multi-ômica sem a necessidade de conhecimentos especializados em programação”.
SIMPLIFICAR A IDENTIFICAÇÃO DE METABOLITOS EM ESTUDOS
Outra vantagem do ‘TurbOmics’, como apontam Ferrarini e Mastrangelo, é sua integração com o ‘TurboPutative’, uma ferramenta desenvolvida anteriormente pelos autores para simplificar a identificação de metabólitos em estudos de metabolômica não direcionada. Essa combinação permite agilizar todo o fluxo de análise, desde a anotação inicial dos compostos até a interpretação biológica dos resultados.
Para avaliar seu desempenho, os pesquisadores aplicaram o ‘TurbOmics’ a dois conjuntos de dados multi-ômicos, em colaboração com o grupo de Biologia de Linfócitos B do CNIC, liderado por Almudena Ramiro. Os resultados demonstraram que a análise conjunta de diferentes tipos de informação permitiu detectar processos biológicos relevantes que passaram despercebidos quando cada tipo de informação foi estudado separadamente.
Segundo os autores, a plataforma representa um avanço importante para democratizar o acesso às metodologias de integração multi-ômica e permitir que a comunidade científica explore todo o potencial dos dados metabolômicos.
Assim, eles afirmam que a colaboração de diferentes grupos do CNIC neste trabalho contribui para o desenvolvimento de ferramentas bioinformáticas abertas que facilitam a pesquisa biomédica e aceleram a obtenção de novos conhecimentos sobre os mecanismos biológicos e as doenças.
Esta notícia foi traduzida por um tradutor automático